O Auto de Licença de Funcionamento é um documento, indicado principalmente para empresas consideradas de alto risco de acordo com o sistema da prefeitura, que autoriza o funcionamento de atividades comerciais, institucionais, industriais, de prestação de serviços e similares, observando os critérios de incomodidade e zoneamento do imóvel, desde que este esteja devidamente regularizado junto à prefeitura.

Esse documento gera uma licença definitiva. No entanto, sempre que houver alterações ao tipo ou característica da atividade, modificações na edificação utilizada, alteração da razão social ou a propriedade do estabelecimento, será necessário uma nova licença.